歐洲的毛犀?；驈牟妒痴呒S便中的DNA重建

我們可能忽略了一個(gè)令人驚訝的豐富的古代DNA來(lái)源。

科學(xué)家們已經(jīng)設(shè)法重建了已滅絕的毛犀牛的線粒體基因組（Coelodonta antiquitatis 古齒獸） – 從洞穴鬣狗的糞便化石中提取的 DNA （Crocuta crocuta spelea）在上面吃飯。

這是歐洲第一個(gè)發(fā)現(xiàn)毛犀牛的基因組;該物種之前的所有基因組數(shù)據(jù)都來(lái)自西伯利亞動(dòng)物。這也許可以為我們提供一些關(guān)于犀牛群之間區(qū)域差異的線索——但它也表明糞便化石，或共云母，可能是一種寶貴的資源。

“這里產(chǎn)生的有絲分裂基因組組裝是歐洲毛犀牛的第一個(gè)有絲分裂基因組記錄，因此是幫助解決這一標(biāo)志性更新世巨型動(dòng)物物種系統(tǒng)地理學(xué)的重要資源，”研究人員在他們的論文中寫(xiě)道.

“事實(shí)上，這些都是從另一個(gè)物種的coprolite中相對(duì)容易地檢索到的（即不需要與毛犀牛直接相關(guān)的遺?。?，這強(qiáng)調(diào)了從各種材料中獲取基因組數(shù)據(jù)的價(jià)值。

實(shí)際上，coprolites被證明是一座歷史悠久的金礦。從保存的糞便中，我們可以計(jì)算出什么人和動(dòng)物吃了在過(guò)去，仔細(xì)研究他們感染的寄生蟲(chóng)，甚至學(xué)習(xí)人體腸道微生物組的變化.

由德國(guó)康斯坦茨大學(xué)的分子生物學(xué)家彼得·安德烈亞斯·西伯（Peter Andreas Seeber）領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)團(tuán)隊(duì)研究了兩種鬣狗糞便化石。舊石器時(shí)代中期在現(xiàn)在的德國(guó)，這一時(shí)期大約在 300,000 到 30,000 年前。

這些共生巖已被挖掘出來(lái)并坐在博物館藏品如現(xiàn)在許多共生巖都這樣做了.去年發(fā)表的一篇論文斷言博物館藏品中的共生巖是研究地球生物歷史時(shí)被忽視和未充分利用的資源。

Seeber和他的同事們使用一種特殊的工具從共生巖內(nèi)部提取材料，準(zhǔn)備DNA進(jìn)行讀取，并通過(guò)DNA測(cè)序儀運(yùn)行結(jié)果。

DNA被降解;但研究人員設(shè)法從洞穴鬣狗和毛犀牛中恢復(fù)了遺傳物質(zhì)，并將它們與其他現(xiàn)代和古代基因組進(jìn)行了比較。

而且，盡管犀牛的DNA僅從單個(gè)樣本中獲得，但它能夠告訴研究人員有關(guān)該物種及其在歐亞大陸上的多樣性的新信息。

事實(shí)上，最終成為鬣狗的歐洲犀牛和西伯利亞犀牛之間存在足夠的差異，這表明這兩個(gè)群體在很久以前就開(kāi)始多樣化。歐洲犀牛在 250 萬(wàn)到 150,000 年前的某個(gè)時(shí)候開(kāi)始分裂。

這與犀牛在更新世晚期反復(fù)向西歐擴(kuò)張的假設(shè)直接矛盾，至少對(duì)于這頭犀牛所屬的崩潰而言是這樣。

進(jìn)一步恢復(fù)和分析這些古老、雄偉的犀牛的DNA，將有助于揭示更多關(guān)于它們的歷史，即使我們必須從像糞便這樣絕對(duì)不雄偉的東西中恢復(fù)它。

“和這些樣本一樣，”研究人員寫(xiě)道，“在過(guò)去的發(fā)掘中發(fā)現(xiàn)并存在于收藏品中的許多考古物品，迄今為止在很大程度上被忽視了古代DNA的來(lái)源。

該研究已發(fā)表在生物學(xué)快報(bào).

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